Les abattoirs et le marché aux bestiaux de la Mouche (1906-1914) sont loin d’être les seules réalisations de Tony Garnier à Lyon. Elles marquent plutôt les débuts d’une longue collaboration entre l’architecte et le maire de la ville, Édouard Herriot (1872-1957).
Tony Garnier réalise, morceaux par morceaux, les grands équipements de son projet de “Cité industrielle”, présentée à Paris en 1904. Il conçoit entre 1911 et 1933 l’hôpital Grange-Blanche (baptisé depuis Édouard-Herriot), dont l’organisation rigoureuse rappelle le plan de circulation de la Mouche. Vers 1914, les travaux pour le stade de Gerland débutent ; en 1926, 30 000 spectateurs peuvent assister aux plus grandes compétitions sportives. Le dernier grand chantier concerne le logement : inaugurée en 1933, la cité des États-Unis, située dans le 8e arrondissement (au sud-est de la ville), est destinée à loger, dans les conditions les plus favorables (eau, chauffage, électricité), environ 12 000 personnes.
Il faut ajouter à ces quatre grandes commandes publiques d’autres chantiers de grande importance : la Vacherie du parc de la Tête-d’or (1904-1905, Lyon 1er arr.), le central téléphonique Vaudrey (1913-1933, Lyon 3e arr.) et l’école de tissage (1927-1934, Lyon 1er arr.).