Cluny III, ou major ecclesia, est construit entre 1088 et 1130. Les dimensions de la nouvelle église dépassent largement les ambitions des précédents chantiers de l’abbaye. Cluny devient la plus grande église au monde jusqu’au XVIe siècle, avec des dimensions hors du commun : 187 m de longueur, une quarantaine de mètres en élévation sous la coupole du grand transept, cinq nefs, deux transepts, 301 fenêtres, cinq clochers. Le plan, à la fois centré et basilical, rappelle à la fois les édifices byzantins (Sainte-Sophie) et romains (Saint-Pierre de Rome) – on parle alors de plan archiépiscopal.