La tour est repeinte tous les sept ans pour maintenir le métal en bon état ; l'opération dure 18 mois, emploie 25 peintres et nécessite 60 tonnes de peinture.
Trois nuances différentes de couleur assurent une apparence homogène à la tour dans le ciel de Paris : la peinture est plus claire en haut.
La couleur a changé selon les époques : brun-rouge en 1889, elle devient ocre-jaune en 1892, puis bronze depuis 1968.